Season
Episode
- Episode 1: 第27集 炎之星的出走
- Episode 2: 第28集 校长的危机
- Episode 3: 第29集 萌战士的威胁
- Episode 4: 第30集 乌克娜娜的秘密
- Episode 5: 第31集 飘呀飘的愿望
- Episode 6: 第32集 维多利亚的记忆
- Episode 7: 第33集 暗黑档案X
- Episode 8: 第34集 校长的重罪
- Episode 9: 第35集 渗透的暗黑势力
- Episode 10: 第36集 失忆的幻之星
- Episode 11: 第37集 挑战暗黑势力
- Episode 12: 第38集 拯救焰王
- Episode 13: 第39集 夸克族的叛徒
- Episode 14: 第40集 萌骑士的异想世界
- Episode 15: 第41集 守护黑磁石
- Episode 16: 第42集 智之星与炎之星的对立
- Episode 17: 第43集 夸克族神秘客
- Episode 18: 第44集 萌小姐
- Episode 19: 第45集 轮回血石
- Episode 20: 第46集 智之星即将诞生
- Episode 21: 第47集 女巫来了
- Episode 22: 第48集 抢救轮回血石
- Episode 23: 第49集 大长老的退位
- Episode 24: 第50集 熇炎老师
- Episode 25: 第51集 女巫袭击与熇炎的决心
- Episode 26: 第52集 暗黑大帝的败退
萌学园 萌学园3：魔法号令
是一部很特别的魔法电视剧，也是东森幼幼台开台十周年台庆的大戏，带给观众们一个全新的视觉感受。
萌学园是一个魔法学校，校园里的每个人都有与众不同的魔法，剧中会有很多的特效设计，也有很精彩的感情戏。
